一応の規模をもつ大學教育システムは、數年にわたる改革によって、いっそう充実することになった。708校の大學が1993年に実施し始めた世界一流の大學100校を作り上げるプロジェクトの中で302校の総合大學に合併された。1999年9月に中央工蕓美術學院が清華大學に合併され、2000年4月、100年以上の歴史をもつ北京大學が中國の醫科大學ナンバー?ワンの北京醫科大學と合併した。現在、全國には大學が合計1911校ある。國はまた若干の大學が世界の有名な大學に仲間入りすることをサポートする専門基金を設け、これまで30余校の大學がサポートを受けた。

大學の學生募集數が數年間連続して拡大された。一般大學の學生募集數は1998年に108萬人、1999年から2002年までは160萬人から320萬人に増えたが、2003年には前年比15萬人増の335萬人になる計畫で、大學と科學研究機構は大學院生を前年比33％増の21萬7000人募集する計畫である。

また、大學と科學研究機構は実力を大いに高めたため、科學技術によるイノベーションと基礎研究分野の重要な力となっている。また、大學は産?學?研の協力を強化し、科學技術成果を生産力に転換するテンポを速め、ハイテク企業と重要な技術製品が次々と現れ、22の國家クラス大學科學技術パークがハイテク成果転換の重要な基地となっている。